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常见问题

没有参考基因组的物种可以进行SNP频率差异分析，可以找到候选区段，但是无参定位效果较差，并且缺少注释文件，获得的结果少。无参物种一般情况不推荐做BSA性状定位，建议尝试遗传图谱等方案。

候选区域的大小和候选基因个数的多少，与群体的大小、亲本材料差异的大小、目标性状特点、测序深度的多少、分析物种的基因组水平等多项因素相关，因此不能给出统一的标准，但可以参考已完成的项目经验进行估计。

先提DNA再等量混合，可以减少系统误差，近年发表的多数文献都是先提DNA再等量混合。

简化基因组技术，捕获的基因组信息占基因组大小约1％~10%，全基因组技术，对整个基因组测序，获得的变异信息更全面，性价比更高，数据量单价便宜至少25倍。

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