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美格基因 | 从“肠”计议！细菌分离服务挖掘鱼肠道菌群的“秘密”
发布时间：
2025-08-08
淡水鱼肠道微生物——高通量细菌分离案例实录
1 项目背景
鱼类肠道微生物对其生长发育至关重要，支撑其营养吸收和免疫健康。要深入揭示其生态功能并实现应用转化，获取具有活性的微生物资源是基础和前提。
美格基因联合四川厌氧生物公司采用创新高通量细菌分离培养技术，突破“涂布不生长，挑菌多重复”的困局——2.5个月从10份某品种淡水鱼肠道样本中捕获120个物种（含5个潜在新物种），为鱼类肠道微生物资源挖掘开辟新通道！
2 项目需求
样本：10份某品种淡水鱼肠道内容物样本
分离目标：分离获得100个不同物种（Species），研究微生物区系，建立菌种资源库支撑后续研究开发。
3 传统分离 vs 高通量细菌分离培养
痛点剖析——传统分离为何步履维艰？（仅得36种？）
01 厌氧环境维持不足
样品处理、培养基配制、布板等关键操作在有氧环境下进行，大部分厌氧菌曝氧损伤或死亡。即便依赖的厌氧产气袋也难以维持稳定低氧环境，导致大量严格厌氧菌无法生长。
02 优势菌株过度生长
涂板后，数量多、生长快的优势菌迅速占据主导，后续大量人工挑取往往仅能得到少数重复的优势菌种，分离效率低下。
03 人工操作通量低误差大
挑取单菌落、纯化和初步鉴定过程依赖繁重人工，面对高密度菌落时通量有限、速度慢、易遗漏稀有物种且易造成误差，极大制约多样性挖掘。
解决方案——高通量细菌分离培养技术的核心优势
01 全程严格厌氧控制
所有操作（样品前处理、布板、培养、保藏等）均在专用手套箱内完成，持续维持超低氧环境（O₂ < 1 ppm），保证严格厌氧菌的可培养性。
02 多样化培养条件优化
采用多种培养基及优化培养方法组合，最大化覆盖不同菌种的生长条件。
03 高通量自动化与智能筛选
高精度机械臂替代人工进行单菌落挑取和菌液转移，实现高通量、标准化操作。应用MALDI-TOF-MS对菌株进行高通量、快速初鉴定，高效识别并剔除优势菌的冗余克隆，精准定位目标菌落。
图1 高通量细菌分离培养服务通用实验流程图（具体实验方案以项目实际为准）
价值总结——为何选择高通量细菌分离培养服务？
01 超高效获取活菌株资源，快速构建多样性菌种资源库
02 显著缩短交付周期
不想再为耗时耗力重复分离却不得结果而费心？
不愿再被有限的经费阻碍细菌分离的脚步？
以上种种全都交给【高通量细菌分离培养服务】代劳吧！
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