美格基因 | 单细胞转录组/单细胞核转录组测序服务,让每一个细胞都讲述自己的故事!
发布时间:
2025-03-07
在生命科学研究的星辰大海中,每一个细胞都是独特的宇宙。传统Bulk RNA测序将细胞群体"一锅端"的检测方式,正在被单细胞测序技术彻底颠覆。通过捕获单个细胞的基因表达指纹,研究者能够更深入理解细胞分化、细胞间的关系以及如何从细胞的视角去看待分子过程。

普通转录组(左)和单细胞转录组(右)检测的基因表达信息
什么是单细胞转录组/单细胞核转录组?
单细胞转录组测序(scRNA-seq),是指在单个细胞水平上对转录组进行高通量测序,从而获得单细胞水平的转录图谱的技术,可用于揭示细胞间的异质性和复杂性。
单细胞核转录组测序(snRNA-seq),则是通过提取样本单细胞核,然后分离、标记细胞核,在单细胞水平研究核基因表达检测的技术。为脑组织、心脏、肾脏等复杂组织或一些珍稀冻存样品提供了单细胞水平研究应用平台,可挖掘更多潜在的致病细胞类型,更易于探讨肿瘤细胞异质性和致病机理。
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实验流程

分析流程

分析结果展示
单细胞亚群分类umap图

marker基因dotplot图

GO富集分析柱状图

不同细胞群体Marker基因差异倍数-表达比例差值火山图
应用领域
1. 肿瘤研究
肿瘤异质性、肿瘤微环境、癌症治疗
2. 神经生物学
神经系统疾病机制、神经系统发育过程
3. 免疫系统研究
免疫细胞分化、免疫缺陷疾病研究、构建免疫图谱
4. 发育生物学
胚胎细胞发育、器官发育、基因表达时序性研究
5. 干细胞研究
干细胞分类、干细胞分化研究
6. 植物学研究
植物细胞类型异质性、植物细胞分化轨迹
7. 细胞图谱构建
文献速递
文章题目:ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models
中文题目:在Wolfram综合征模型中抑制ISR能够逆转胰岛β细胞衰竭
发表期刊:Cell Death & Differentiation
影响因子:12.400
发表时间:2024.02
摘要:本研究利用人类多能干细胞(hPSCs)衍生的胰岛和小鼠模型来模拟WS中的β细胞衰竭,并通过DNBelab C系列单细胞转录组测序技术绘制了高分辨率的细胞命运轨迹图,揭示了两种不同的细胞命运:成熟分支和应激分支。这项研究揭示了Wolfram综合征中胰岛β细胞衰竭的分子机制,并提出了通过抑制ISR来治疗WS糖尿病的新策略。ISRIB作为一种潜在的治疗药物,为WS糖尿病的治疗提供了新的方向。

图:对来自野生型(WT)和WFS1基因敲除人胚胎干细胞的体外分化SC-胰岛进行单细胞RNA测序分析。
文章题目:Mapping the single-cell transcriptomic response of murine diabetic kidney disease to therapies
中文题目:绘制小鼠糖尿病肾病对治疗的单细胞转录组响应图谱
期刊名称:Cell Metabolism
影响因子:31.373
发表时间:2022.06
摘要:该研究利用单细胞核转录组测序(snRNA-seq)对小鼠糖尿病肾病进行了药物研究,百万级别的细胞图谱显示,所有肾细胞类型对 DKD 及其治疗均有异质反应。单一疗法和联合疗法针对不同的细胞类型,并诱导了明显的转录变化。钠-葡萄糖协同转运蛋白 2 抑制剂(SGLT2i)在近端小管 S1 段的早期影响表明,这类药物可以诱导禁食模拟和缺氧反应。糖尿病肾病模型中近端小管中剪接体调节蛋白丝氨酸/精氨酸丰富剪接因子 7(rsf7)下调,该因子又可被 SGLT2i 特异性恢复。在体外,近端小管敲除 Srsf7 诱导了一种促炎症表型,这意味着可变剪接是 DKD 的驱动因素,表明了 SGLT2i 调控近端小管的可变剪接是这类药物的潜在作用机制。

图: DKD 进展过程中的基因表达变化
单细胞转录组测序不仅是技术工具,更是打开生命微观宇宙的钥匙。从揭示疾病机制到指导个体化治疗,从解析发育奥秘到优化再生策略,这项技术正以“细胞级精度”推动生命科学迈向新纪元。正如诺贝尔奖得主Sydney Brenner所言:“细胞的多样性是生命的本质,而单细胞技术让我们第一次真正触摸到这种本质。”
参考文献:
[1] Hu R ,Chen X ,Su Q , et al.ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models.[J].Cell death and differentiation,2024,31(3):322-334.
[2]Haojia, Wu., et al. Mapping the single-cell transcriptomic response of murine diabetic kidney disease to therapies. Cell Metabolism. 2022, 34: 1064-1078.e6.
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