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全球首发 | 美格基因MetaTrue-Quant™：突破相对定量局限，开启宏基因组（绝对定量）新纪元！！

发布时间：

2026-02-28

传统宏基因组测序能够回答“谁多谁少”，却无法回答“到底有多少”——这一直是制约微生物组研究走向精准化的“最后一公里”问题。今天，美格基因正式发布MetaTrue-Quant™宏基因组（绝对定量）产品，不同于基于标准曲线绝对定量方案（校准型方案），该技术通过设计并引入多种外源性及合成内标（涵盖3个区段，共79条内标），有效规避内标序列与样本来源重叠导致的检测模糊，实现了高通量基因定量的精准化。同时，研究团队开发了新的数学模型，引入关键参数——测序产率（Yseq），将测序获得的碱基数与目标基因的绝对浓度建立关联，实现了对样本中基因的高通量、准确定量，真正做到了“数”说微生物。

为什么要开展宏基因组绝对定量？

自2005年高通量测序技术普及以来，宏基因组学已成为解析微生物群落结构、功能及演替规律的核心工具。然而，传统宏基因组测序仅能输出相对丰度数据——即某一物种或基因在样本总测序序列中的占比。这种“百分比式”结果虽能反映群落内部的相对比例关系，却存在根本性缺陷：无法回答“到底有多少”。

（1）宏基因组（相对定量）的主要局限：

仅反映比例关系：数据描述的是基因在封闭样本系统中的相对比例，而非真实绝对丰度；
受多基因相互影响：某一基因相对丰度的变化，既可能源于自身表达的改变，也可能由样本中其他基因丰度波动引起。

（2）导致的科研困境：

变化方向难以判断：相对丰度下降，并不必然意味着该基因绝对数量的减少；
缺乏统一参照系：不同时间点或不同样本构成独立的“封闭系统”，其比例数据无法直接比较；
跨样本可比性差：在非同一系统中，5%的相对丰度并不一定代表低于10%的绝对水平。

随着研究不断深入，科学界日益认识到，相对丰度数据的局限性已成为制约微生物组研究向精准化、定量化发展的“最后一公里”。宏基因组绝对定量技术正是为突破这一瓶颈而生，成为新一代微生物组研究的技术高地。

MetaTrue-Quant™技术详解

美格基因MetaTrue-Quant™通过在DNA样本中添加多个已知浓度并携带特定合成标记的人工内标片段（涵盖3个区段、共79条内标），使其与样本一同进行宏基因组建库与测序。基于内标在样本中的投入质量比与其测序获得的序列读长比，计算得出关键参数——测序产率（Yseq），用于表征从DNA输入到序列输出的全过程效率。利用该参数，可将目标基因的测序数据直接转换为样本中的绝对基因拷贝数，从而实现无需预设引物、高通量、跨样本可比的绝对定量分析。该技术突破了传统宏基因组测序仅能提供相对丰度的局限，通过引入人工内标序列，精准计算样本中微生物基因和物种的绝对拷贝数，真正实现了“从比例到数量”的跨越。

（1）工作流程

（2）测序策略

采取PE150测序策略，数据量为10 G raw data，兼容主流测序平台。

（3）送样要求

（4）方法文章及部分引用方法文章

核心优势

（1）内标设计的先进性（多浓度、多结构内标，拟合更稳定）

多浓度覆盖：内标涵盖多个浓度梯度，适配样本中微生物基因丰度差异大的场景，有效解决了传统方法浓度梯度有限、极值判断不足的问题；
多结构设计：内标序列覆盖不同片段长度和GC含量，模拟真实样本中微生物DNA的多样性，降低因结构差异引入的定量偏差；
方法稳定性验证：在多种复杂样品基质及不同测序平台条件下，外源内标的单位质量信号响应比例保持稳定，系统性波动不超过6.2%；在对数尺度下，内标实测拷贝与理论加入拷贝数之间的拟合相关系数R²均> 0.98，具备良好的跨条件方法一致性。

（2）方法学验证结果（与qPCR高度一致）

准确性相当，无系统性偏差：从绝对定量和相对丰度两个维度验证，MetaTrue-Quant™与qPCR结果无显著差异（P=0.56/0.59），双重验证增强了结论可信度；
精密度更高，变异更小：在三个重复样本中，MetaTrue-Quant™的平均变异系数（CV）为6.7%/11.8%，显著低于qPCR的25.8%/51.8%（配对t检验，P=0.03/0.01）；
检测一致性佳，无假阳性：基因qnrS在两种方法中均未检出，证明MetaTrue-Quant™具备与qPCR相当的特异性。