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环境DNA单物种检测

环境DNA单物种检测

环境DNA单物种检测


环境DNA

环境DNA(environmental DNA,eDNA),是从环境样品(如水、土壤、空气等)中直接提取到的DNA片段的总和,是来自微生物、动物、植物等不同物种DNA的混合物,既包含生物体经由皮肤、尿液、粪便、粘液等释放到环境中表皮细胞的胞内DNA,也包括细胞死亡后裂解释放到环境中的胞外DNA。

 

环境DNA单物种检测

从水体、粪便、羽毛、土壤等环境样本中提取生物遗传信息,采用针对单物种高度特异性的一对或多对扩增引物,对该目标物种特异性靶序列进行扩增,实现目标物种的精准监测,也可分析样本间eDNA拷贝数差异评估目标物种的时空分布情况。

壹健既承接环境样本提取、PCR扩增、出具报告的送检服务,也提供新物种引物设计、检测体系构建的个性化定制服务。

 

应用方向

外来入侵物种
鳄雀鳝(Atractosteus spatula)

红耳龟(Trachemys scripta elegans)

濒危保护物种
豹猫(Prionailurus bengalensis)中华白海豚(Sousa chinensis)

 

技术特点

非破坏性采样

高准确性

周期短

痕量检测

高性价比

采集环境样本,不会危害到目标物种或破坏采样点生态系统

使用高度特异性的一对或多对引物扩增,避免假阳性和假阴性结果

采用PCR检测技术,快速出具结果

可实现群体规模小、难以察觉或被忽略、隐蔽性强的生物物种的高效鉴别

相对传统形态学调查成本较低

 

送样要求

 

样品类型

样品要求

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水体滤膜

每份样本采集1 L以上体积的水样,经过滤膜(如:0.45 μm孔径醋酸纤维膜)过滤,并将滤膜保存于EP管或冻存管中。滤膜≥ 2张。

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土壤

沉积物

采集表层或不同深度的土壤/沉积物样本,装于EP管或冻存管中,每份样本5 g以上。

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粪便样本

使用无菌牙签或粪便取样器采集粪便样本,装于EP管或冻存管中,每份样本3 g以上。

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空气滤膜

用空气采样装置收集足够体积的空气,经滤膜(如1μm的聚碳酸酯生物膜)过滤,并将滤膜保存于EP管或冻存管中。滤膜≥ 2张。

备注:具体送样方式及要求,可联系销售及技术支持人员予以确认。

 

研究与应用

利用环境DNA调查长江江豚的分布【1】

使用环境DNA调查濒危水生物种的存在和活动范围已被证明是更经济、更有效且无侵入性的研究方法。本研究在长江流域的29个位点采集水样,通过实时荧光定量PCR (qPCR)检测长江江豚(Neophocaena asiaeorientali)的存在和分布情况。结果表明,相比传统目视监测方法,eDNA检测技术在长江江豚监测中具有更高的检出率,可作为长江江豚在长江分布调查的有效工具。

参考文献:

【1】 Tang Y W Y,Liu K L1 4, LIt, Wang Q. Y 4, Xu R lvestgating the distrbution of the Yangtze firless porpoise in the Yangte Rver using envirormental DNA PLosOne.2019 Aug 9:14(8):e0221120.

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