5R 16S测序_技术参数_产品优势_美格基因-发现微生物之美

LAN ▼

English 中文

Back up

产品及服务

PRODUCTS & SERVICES

您现在的位置：

首页

5R微生物多样性（医学）

产品介绍

5R微生物多样性（医学）测序服务是通过对16S rRNA基因上的特定区域（V2、V3、V5、V6、V8）进行多重PCR扩增和测序，来实现对微生物物种的高覆盖率和高分辨率检测。与常规V3V4区扩增策略相比，此方法扩增出的区域覆盖约68%的16S全长序列，可以大幅提高细菌物种检测的覆盖率和分辨率，尤其适合于低微生物量的样品检测，有效降低了组织中宿主DNA对细菌16S rDNA扩增的严重干扰。5R 16S测序技术在医学领域具有广泛的应用前景，特别是在肿瘤微生物组的研究和临床应用方面展现出巨大的潜力。

技术参数

产品	测序策略	数据量
微生物多样性（医学）	NovaSeq PE150	20 w raw reads

应用场景

肿瘤疾病的诊断
肿瘤疾病的发生机制研究
肿瘤疾病预后研究
药代动力学研究

产品优势

覆盖区域长：测序覆盖了16S rRNA基因上的5个区域，约占全长的68%。
鉴定“种”多：更长的16S rRNA基因覆盖，鉴定出更多更准的菌“种”。
检测灵敏度高：适用低微生物量样本如肿瘤组织的菌群检测。
样本宽容度大：适用降解样本中的菌群检测。

实验流程

分析流程

产品介绍

案例（一）

英文标题：The human tumor microbiome is composed of tumor type–specific intracellular bacteria

中文标题：人类肿瘤微生物组由肿瘤类型特异性细胞内细菌组成

发表期刊：Science
发表时间：2020
样本类型：冻存组织和FFPE样本

本文对肿瘤微生物组进行了全面分析，研究了7种癌症类型的1526个肿瘤及其邻近正常组织，包括乳腺癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、黑色素瘤、骨癌和脑瘤。研究发现每种肿瘤类型都有不同的微生物组组成，乳腺癌的微生物组特别丰富多样。肿瘤内细菌主要是细胞内的，存在于癌症和免疫细胞中。研究还注意到肿瘤内细菌或其预测功能与肿瘤类型和亚型、患者吸烟状况以及对免疫治疗的反应之间的相关性。

案例（二）

英文标题：Breast cancer colonization by Fusobacterium nucleatum accelerates tumor growth and metastatic progression
中文标题：核梭杆菌定殖乳腺癌加速肿瘤生长和转移进展
发表期刊：Nature Communications
发表时间：2020
样本类型：乳腺肿瘤组织

核梭杆菌是一种口腔厌氧菌，在人类结肠直肠癌中普遍存在且与不良治疗结果相关。本研究发现，人类乳腺癌进展时Gal-GalNAc水平增加，乳腺癌样本中核梭杆菌gDNA的出现与高 Gal-GalNAc水平有关，该细菌能与乳腺癌样本Fap2依赖性结合，可被GalNAc抑制。血管内接种表达Fap2的核梭杆菌ATCC 23726可定植小鼠乳腺肿瘤，而Fap2缺陷细菌定植受损。接种核梭杆菌抑制肿瘤浸润T细胞积累，促进肿瘤生长和转移，抗生素治疗可抵消。因此，靶向核梭杆菌核酸或Fap2可能对乳腺癌治疗有益。

核状芽孢杆菌ATCC 23726对乳腺癌的依附是Fap2介导的和Gal-GalNAc依赖性的

参考文献
[1] Nejman, D., Livyatan, I., Fuks, G., Gavert, N., Zwang, Y., Geller, L. T., … Gigi, E. (2020). The human tumor microbiome is composed of tumor type–specific intracellular bacteria. Science, 368(6494), 973–980.
[2] Parhi, L., Alon-Maimon, T., Sol, A. et al. Breast cancer colonization by Fusobacterium nucleatum accelerates tumor growth and metastatic progression. Nat Commun 11, 3259 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-16967-2

在线订购

产品订购时需要填写的信息：

为了给您提供更快更好的服务，请认真填写以下信息。收到询价单后，我们对您的信息进行评估，与您联系并给出报价。

感谢您对美格基因的支持和信任。