产品及服务

PRODUCTS & SERVICES

代谢组与转录组联合分析(医学)

代谢组与转录组联合分析(医学)


产品介绍

转录组是功能基因的研究利器,通过转录组测序可以得到基因的表达水平变化,但是难以确定关键途径;代谢组作为表型的直接体现者,通过代谢组可以反映代谢产物的变化,但是无法解释其背后的分子机制。利用转录组+代谢组的联合分析,可以在不同层面对疾病进行研究,2组数据之间相互验证,从而全面系统的解析疾病的发生发展机制。
将转录组筛选得到的差异表达基因与代谢组学筛选的差异代谢物进行联合分析,计算其相关性,构建相关性网络,可以找到引起代谢产物变化的关键基因,为理解疾病的复杂调控机制提供了更为全面的视角。

应用场景

  • 营养与健康研究:通过分析不同饮食或生活方式对转录组和代谢组的影响,可以深入了解营养成分如何调节生理功能,为制定健康饮食指南和预防策略提供科学依据。
  • 药物作用机制研究:评估药物对细胞或组织的转录和代谢影响,可以揭示药物作用的直接目标及后续的代谢响应,帮助优化药物设计,预测药物效果及副作用。
  • 疾病机理研究:通过分析患者与健康对照组的转录组和代谢组数据,可以识别出与疾病相关的基因表达异常和代谢途径变化,帮助科学家理解疾病的分子基础,比如癌症、糖尿病、心血管疾病等的发病机制。
  • 生物标志物的发现:联合分析能够识别出同时在基因表达和代谢水平上发生变化的特征,这些特征作为生物标志物具有更高的诊断和预后价值。例如,特定的代谢物和其相关基因的表达模式可作为疾病早期检测或进展监测的标志。
  • 个性化医疗:基于个体的转录组和代谢组特征,联合分析能够为患者提供更加个性化的治疗建议。

联合分析优势

  • 增强生物学解释力:同时观察基因表达水平和代谢产物的变化,直接链接基因调控与代谢状态,提供更深层次的生物学洞察。
  • 因果关系推断:联合分析能够从“因”(基因转录)到“果”(代谢产物变化)进行追踪,帮助识别关键的分子事件及其对生物表型的影响。
  • 提高发现效率:整合两组数据,聚焦于那些在转录和代谢层面上均有显著变化的基因和代谢物,减少假阳性,提高发现真正生物学标志物或治疗靶点的效率。
  • 识别调控网络:通过识别哪些基因的上调或下调与特定代谢途径的改变相关联,揭示核心调控因子和信号传导路径,为理解系统及调控机制提供线索。

分析流程

分析结果展示

O2PLS模型的得分图

 RDA图

案例解析

案例一:代谢组与转录组联合分析揭示了针对快速增殖乳腺癌的治疗模式

基于转录组和代谢组联合分析,指导针对乳腺癌亚群的新有效治疗策略的选择

 

代谢失调是乳腺癌的关键特点,但其在患者肿瘤中的特性尚不明确。该研究通过非靶向代谢组学方法分析不同类型乳腺癌样本,研究鉴别出两种不同代谢模式,不受癌症具体类型限制:一种富含核苷酸和碳水化合物,另一种则富含脂质和脂肪酸。实验表明,与体外模型相比,体内环境下的细胞培养更能准确反映患者肿瘤代谢状况。研究还通过综合代谢组与转录组数据,识别了与代谢失衡紧密相关并能预示患者预后的基因。实验治疗中,针对“核苷酸/碳水化合物富集”型TNBC采用的嘧啶合成或谷氨酰胺代谢抑制剂展现出治疗潜力,尤其嘧啶合成抑制剂在多种TNBC模型中的疗效优于传统化疗。该研究不仅为乳腺癌的代谢分类及针对性治疗策略提供了依据,还创建了公开的交互式数据平台http://brcametab.org,助力后续研究。

 

参考文献:Liao C, Glodowski C R, Fan C, et al. Integrated metabolic profiling and transcriptional analysis reveals therapeutic modalities for targeting rapidly proliferating breast cancers[J]. Cancer research, 2022, 82(4): 665-680.
链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-21-2745

在线订购

产品订购时需要填写的信息:

为了给您提供更快更好的服务,请认真填写以下信息。收到询价单后,我们对您的信息进行评估,与您联系并给出报价。

感谢您对美格基因的支持和信任。

美格基因

美格科服

联系我们

电话:400-968-5700

官网:www.magigene.com

地址:广东深圳国际创新谷三期7栋B座13层

地址:广州国际生物岛官洲生命科学中心A栋第28层

地址:广州国际生物岛螺旋四路7号二期3栋4层

Copyright © 2023 广东美格基因科技有限公司

SAF Coolest v1.3 设置面板DEJSX-ZGZB-AVSQE-XEQ

图片ALT信息: 广东美格基因科技有限公司

无数据提示

Sorry,当前栏目暂无内容

您可以查看其他栏目或返回 首页

V1.3.1 SVG图标库请自行添加图标,用div包起来,并命名使用