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美格基因芯片


产品介绍

产品应用

检测案例

案例一:巢湖蓝藻爆发前期、中期、后期的水体样本检测
结果可重复性高:组内差异显著低于组间差异,藻华爆发不同阶段伴随群落多样性降低和个别菌株强势生长相关性环境因子检出率高于16S等方法。

案例二:全国十个不同来源的水体样本检测
该实验样本取自中国10个不同的地方(郑州、兰州、厦门、深圳、广州、西安、昆明、合肥、北京、重庆),共计32个样本,在2张芯片上一次性完成检测。共检出419种不同类型的蓝藻,每个样本平均检出144种蓝藻,最高的检出356种,最低50种。NMDS分析展示了更大的组间差异和更小的组内差异,说明相同来源样本间具有更高的蓝藻群落组成和结构相似性

蓝藻

蓝藻又名蓝细菌、蓝绿藻。革兰氏染色阴性,不含叶绿体(区别于真核生物的藻类)、能进行产氧性光合作用的大型单细胞原核生物,广泛存在于各种水体和其他环境中。在一些营养丰富的水体中,有些蓝藻常于夏季大量繁殖,并在水面形成一层蓝绿色而有腥臭味的浮沫,称为“水华”。
蓝藻的危害:影响环境景观,影响水源地供水安全,破坏水生生态系统,蓝藻毒素危害人类和其他动物的健康。

环境功能基因芯片

以GeoChip为代表的环境功能基因芯片是国际基因芯片产业发展的重要方向,是全球微生态学和环境基因组学研究的重要手段之一,适用于复杂样本中特定基因、物种、和功能过程的高效检出和定量。高通量基因芯片技术能极大的降低非特异性核酸序列干扰,具有高灵敏度和高重现性的特点,对生态环境监测产生深远的影响。从2002年第一代芯片GeoChip1.0成功研发至今,基于GeoChip方法的SCI论文已经超过1000篇,产生了大量理论和应用研究成果。

蓝藻芯片 (CyanoChip) 

针对蓝藻准确快速检测需求开发的一款高度专业化、集成化的基因芯片。该产品基于包括1,322株蓝藻完整基因组序列的美格蓝藻数据库设计探针,每张芯片包含8*45,138个特异性检测探针,可以实现对16个样本中蓝藻的株水平识别和定量检测。这款芯片可应用于各种水体和土壤结皮中蓝藻的检测,在这些生态系统中,蓝藻的多样性和动态变化都是研究人员或监测部门非常关注的问题。

 

 

 

蓝藻芯片设计

实验流程

样本采集
DNA提取
核酸检测
荧光标记
芯片杂交
芯片扫描成像

分析流程

产品交付结果

产品优势

样品优势

滤膜样本核酸样本
水体样本送样须为过滤后的滤膜,过膜体积1-5LDNA浓度≥20ng/ul  DNA量>500ng/样本
样本保存:放置于-80C冰箱长期保存样品DNA保存:放置于-80C冰箱长期保存
样品运输: 送样时置于PE管内,使用干冰运输样品运输:送样时置于PE管内,使用干冰运输

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