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病毒基因组


产品介绍

单病毒基因组以培养或自然样本中病毒为研究对象,先分离单个病毒颗粒并进行全基因组扩增,获取基因组序列信息后对病毒进行鉴定,并根据目标病毒的参考基因组情况配置相应的分析流程。
通过对病毒进行全基因组学测序分析,将很大程度上利于鉴定新发的传染病、开发快速检测试剂、开发疫苗、药物和推测传播途径。此外,对于提升我们对病毒多样性、适应性、生态学特性以及进化的理解具有重要意义。

技术参数

产品

测序平台

测序策略

单病毒组

Nova PE150

1G raw data

 

实验流程

样本采集
核酸提取与质检
文库质备及库检
上机测序

分析流程

案例解析

案例一:陆生节肢动物中的新病毒揭示了单链DNA病毒的多样性
在本研究中,作者通过对陆生节肢动物的病毒进行测序并获得对应的病毒基因组信息,通过系统发育分析展示了病毒的进化情况和多样性,进一步分析发现大部分已知的环状编码ssDNA病毒(CRESS DNA)在无脊椎动物中广泛的分布,反映其古老的进化历程和研究的重要性。

节肢动物病毒系统发育树
 

参考文献:Rosario K, Mettel KA, Benner BE et al.Virus discovery in all three major lineages of terrestrial arthropods highlights the diversity of single-stranded DNA viruses associated with invertebrates[J].Peer J,2018,6(3):e5761.

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