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宏转录组


产品介绍

宏转录组测序是以特定环境中的整个微生物群落作为研究对象,它摆脱了微生物难分离难培养的技术限制,只需从样品中提取全部微生物的总RNA进行测序。
宏转录组测序采用Novaseq第二代高通量测序平台,对样品中微生物群落的RNA做全面测序,经过组装、基因预测、基因注释与丰度计算等分析,挖掘样品中物种组成、功能基因转录调控和代谢通路等遗传多样性和分子生态信息。

产品特点

  • 可以从转录水平鉴定微生物群落,研究群落特征;
  • 鉴定目标病原体;
  • 挖掘活性微生物及功能;
  • 关注关键基因,探索基因功能与代谢途径。

技术参数

产品

测序平台

测序策略

宏转录组

Nova PE150

10 G raw data

实验流程

Total RNA提取

RNA质检

mRNA纯化与片段化 

双链cDNA合成 

末端修复加A和接头 

降解cDNA第二条链 

片段选择和PCR富集 

文库质检 

上机测序 

分析流程

分析结果展示

三元相图

基因数目花瓣图  

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