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美格基因·新品上线｜性价比之王—高通量转录表达谱（HT-RNAseq）

发布时间：

2023-05-17

从2023年5月10日至2023年6月30日，高通量转录表达谱尝鲜价低至360元/样品，此价格包含全流程（提取、建库、测序和分析费用），起送量需要大于10个，更优惠的价格更适合大样品量的研究。冰箱里藏着几十上百个样品的您可点击下方联系第一时间获取您身边的美格基因销售经理的联系方式！

更简单高效的实验流程

基于3’端建库技术方案，使用反转录组（RT）引物捕获mRNA的3’端，该引物包括oligo-dT、UMI和Illumina-compatible 5’adaptor组成。在逆转录过程中，oligo-dT作为引物捕获mRNA的3’poly-A尾。紧接着使用RNase H 特异性水解酶水解DNA-RNA杂交链中的RNA链，然后使用随机引物合成第二链。最后筛选合适的片段大小并加上测序专用文库接头，即完成建库实验。相比于传统转录组，简化成仅需5个步骤，无需额外的poly（A）富集处理、打断和3’端加A等步骤。

更有针对性的分析流程

相比于传统转录组，基于3’端建库技术的高通量转录表达谱仅对3’端附近的mRNA序列进行测序，因此对数据量要求大大降低，针对一般的有参物种仅需要2Gb即可达到测序饱和状态。高通量转录表达谱沿用单细胞转录组的定量思路，并且与传统转录组比较，在基因定量准确性、功能富集一致性和基因检出率等方面均能媲美[1]。

全新的高通量转录表达谱分析流程着重提供基因定量、基因注释、差异分析和富集分析等结果，也可与LncRNA、miRNA、circleRNA、代谢组和蛋白组等进行关联分析，深入研究转录表达调控机制。

参考文献：

[1]Pan X. MustSeq, an alternative approach for multiplexible strand-specific 3’ end sequencing of mRNA transcriptome confers high efficiency and practicality. RNA Biol. 2021 Oct 15;18:232-243. PMID: 34586036.

挑战更有难度的样品

传统转录组是针对mRNA全长序列进行测序，因此对RNA的完整性要求较高。而高通量转录表达谱只要mRNA的3’端附近结构完整即可进行建库测序，因此对RNA完整性要求不高，可以适用于轻微降解样品，甚至是FFPE样品。