微生物组学Microbial Genomics

COMMON PROBLEMS常见问题

  • 宏病毒组技术与宏基因组及扩增子技术的共同点与区别

    宏病毒组技术与宏基因组技术及扩增子技术都是从样品中的总DNA出发进行研究的,避免了对微生物进行分离纯化和培养,提供了对样品中的全部微生物进行研究的新技术。在扩增子技术中,其主要对微生物DNA上的某一段区域,如16S V3/V4/V3-V4等区域进行扩增、测序和分析;在宏基因组技术中,则会使用样品中的所有微生物基因组DNA进行研究,并完成后续一系列数据处理和挖掘;而在宏病毒组技术中,其主要以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,分析样品中的病毒构成信息。

  • 宏病毒组的研究应用

    宏病毒组学可以全面解读样品中病毒的多样性与丰度,探索病毒之间以及与环境和宿主之间的关系。由于宏病毒组学的研究对象是特定环境中病毒的总DNA+cDNA,因而不需要对微生物进行分离培养和纯化,且可以对样品中的DNA病毒和RNA病毒都进行研究,这对我们研究样品中的总病毒提供了一条新的途径。在短短的几年里,人们用这种方法发现了很多有意义的病毒,并扩大了很多病毒的宿主范围,增强了人们对环境中包括媒介生物的病毒组成的了解,研究领域涉及到人类肠道、动物组织、血液、水体等,充分显示出宏病毒组技术在病毒发现、病原溯源、微生物预警等方面的应用价值。